Sub-lineages of the Omicron variant of SARS-CoV-2: characteristic mutations and their relation to epidemiological behavior / Sub-linajes de la variante Ómicron del SARS-CoV-2: mutaciones características y su relación con el comportamiento epidemiológico

Abstract By the end of 2021, the Omicron variant of SARS-CoV-2, the coronavirus responsible for COVID-19, emerges, causing immediate concern, due to the explosive increase in cases in South Africa and a large number of mutations. This study describes the characteristic mutations of the Omicron variant in the Spike protein, and the behavior of the successive epidemic waves associated to the sub-lineages throughout the world. The mutations in the Spike protein described are related to the virus ability to evade the protection elicited by current vaccines, as well as with possible reduced susceptibility to host proteases for priming of the fusion process, and how this might be related to changes in tropism, a replication enhanced in nasal epithelial cells, and reduced in pulmonary tissue; traits probably associated with the apparent reduced severity of Omicron compared to other variants.

Resumen A finales de 2021 surge la variante Omicron del SARS-CoV-2, el coronavirus responsable de la COVID-19, causando preocupación inmediata, debido al aumento explosivo de casos en Suráfrica, y a su gran cantidad de mutaciones. Este estudio describe las mutaciones características de la variante Ómicron en la proteína de la Espiga (S) y el comportamiento de las sucesivas olas epidémicas asociadas a la circulación de sus sub-linajes en todo el mundo. Las mutaciones en la proteína S descritas están relacionadas con su capacidad para evadir la protección provocada por las vacunas actuales, así como su posible susceptibilidad reducida a las proteasas del hospedero para la preparación del proceso de fusión. Se infiere cómo esto podría estar relacionado con su cambio en el tropismo, con una replicación mayor en las células epiteliales nasales y menor en el tejido pulmonar, rasgos probablemente asociados a su aparente menor gravedad en comparación con otras variantes.

Detection of the Omicron variant of SARSCoV-2 by restriction analysis targeting the mutations K417N and N440K of the spike protein / Detección de la Variante Ómicron del SARS-CoV-2 por análisis de restricción de dos mutaciones de la proteína de la espiga

Abstract By the end of 2021, the Omicron variant of concern (VOC) emerges in South Africa. This variant caused immediate concern, due to the explosive increase in cases associated with it and the large number of mutations it exhibits. In this study, the restriction sites that allow detecting the mutations K417N and N440K in the Spike gene are described. This analysis allows us to propose a rapid method for the identification of cases infected with the Omicron variant. We show that the proposed methodology can contribute to provide more information on the prevalence and rapid detection of cases of this new VOC.

Resumen Para finales de 2021 surge la variante de preocupación (VOC por sus siglas en inglés) Ómicron en Sudáfrica. Esta variante causó de forma inmediata preocupación, debido al aumento explosivo de casos asociados a ella y al gran número de mutaciones que exhibe. En este estudio, se describen los sitios de restricción que permiten detectar dos de estas mutaciones en el gen de la espiga, las mutaciones K417N y N440K. Este análisis permite proponer un método rápido para la identificación de casos infectados con la variante Ómicron. Mostramos que la metodología propuesta puede contribuir a proporcionar más información sobre la prevalencia y a detectar rápidamente los casos de esta nueva VOC.

Asociación del peso al nacer con adiposidad en niños escolares de distintas regiones de argentina / Association of birth weight with adiposity in school children from different regions of argentina

Introducción: diversos estudios han sugerido que el bajo y alto peso al nacer (PN) se asocian a obesidad (OB) y sobrepeso (SP) durante la infancia y la edad adulta. Objetivos: determinar la asociación entre PN y OB en escolares de 9 años de tres regiones de Argentina. Materiales y métodos: las medidas antropométricas y la presión arterial (PA) se tomaron en 1.131 escolares (505 masculinos) de 8,8±2,1 años de edad promedio, en tres regiones de Argentina durante el año 2019. Se interrogó, además, acerca del peso al nacer y el estilo de vida. Resultados: el 21,1% (239) de los niños presentaba SP (IMC>85 <95 percentilo según CDC) y el 21,8% (246) OB (IMC>95 percentilo). La prevalencia de PN bajo (<2.500 g) fue de fue de 6,2% (n=70) y de PN alto (>4.000 g) de 7,3% (n=82). El puntaje z-IMC de los niños de 9 años aumentaba significativamente con el aumento del PN: PN bajo (z-IMC=0,33), normal (z-IMC=0,72) y alto (z-IMC=1,12). En modelos de regresión logística múltiple se observó que el PN bajo se asoció inversamente a la OB (OR, 0.41 [IC del 95%: 0,19-0,92]), mientras que el PN alto se asoció directamente con la OB ajustado por edad y sexo (OR, 2.48 [95% IC 1,53-4,02]). Conclusiones: nuestros datos indican que el alto PN, pero no el bajo PN, se asocia con OB en niños en edad escolar de 9 años, mientras que el bajo PN está inversamente asociado con OB.

Introduction: several studies have suggested that low and high birth weight are associated with obesity (OB) and overweight (OW) during childhood and adulthood. Objectives: to determine the association between birth weight and OB in 9-year-old schoolchildren from three areas of Argentina. Materials and methods: anthropometric measurements and blood pressure (BP) were taken in 1.131 schoolchildren (505 males) of an average age of 8.8±2.1 years in three areas of Argentina during 2019. Mothers were asked about their children's birth weight and lifestyle. Results: 21.1% (239) of the children had OW (BMI>85 <95 percentile according to the CDC) and 21.8% (246) OB (BMI>95 percentile). The prevalence of low birth weight (<2.500 g) was 6.2% (n=70) and of high birth weight (>4.000 g) was 7.3% (n=82). The 9-year-old z-BMI score increased significantly with increasing birth weight: low birth weight (z-BMI=0.33), normal (z-BMI=0.72) and high (z-BMI=1.12). In multiple logistic regression models, it was found that low birth weight was inversely associated with OB (OR, 0.41 [95% CI: 0.19-0.92]), while high birth weight was directly associated with OB adjusted for age and sex (OR, 2.48 [95% CI 1.53-4.02]). Conclusions: our data indicate that high birth weight, but not low birth weight, is associated with OB in 9-year-old schoolchildren, while low birth weight is inversely associated with OB

Prevalence of anemia and deficiencies of iron, folic acid and vitamin B12 in an indigenous community from the Venezuelan Amazon with a high incidence of malaria

El objetivo de este trabajo fue estudiar la prevalencia de anemia y de las deficiencias de hierro, ácido fólico y vitamina B12 en Betania del Topocho, población indígena de la etnia Piaroa, del Estado Amazonas, Venezuela, una zona con alta incidencia de malaria. Se estudiaron 184 sujetos de todas las edades que asistieron al Centro de salud para despistaje de malaria. Se realizó hematología completa por Coulter counter, la cuantificación de ferritina por ELISA con anticuerpos monoclonales, y la determinación de ácido fólico y vitamina B12 séricas por un ensayo inmunoradiométrico. La prevalencia de anemia fue de 89.6 por ciento y las deficiencias de hierro, ácido fólico y vitamina B12 afectaron 37.1, 70.3 y 12.4 por ciento de la población estudiada, respectivamente. La infección con Plasmodium fue detectada por diagnóstico molecular en el 53.2 por ciento de los casos, y 86 por ciento de ellos eran anémicos. La mayor incidencia de anemia fue encontrada en niños, con una prevalencia de 100 por ciento en lactantes de ambos sexos. La alta prevalencia de anemia y deficiencias de hierro y ácido fólico indican un problema de salud y de nutrición importante en esta comunidad que debe ser tratada de forma adecuada y urgente. Los casos de anemia debidos a deficiencia de hierro, podrían estar siendo subestimados, ya que la ferritina sérica es también una proteína de fase aguda que aumenta en caso de infección, aunque los datos de prevalencia fueron también analizados con un punto de corte de 30 µg/L para la concentración de ferritina.